Film, insanlığın kökenlerini araştıran bir grup bilim insanının uzaydaki yolculuklarını ve korkunç keşiflerini konu alıyor. Yıl 2093’tür. Arkeolog Elizabeth Shaw (Noomi Rapace), İskoçya’daki bir mağarada uzaylı bir haritayı keşfeder. Harita, insanoğlunun yaratıcıları olduğuna inandığı “Yaratıcılar” adlı bir ırkın gezegenine işaret etmektedir. Shaw, David adında bir android (Michael Fassbender) ile birlikte Prometheus adlı bir uzay gemisine biner ve Yaratıcıların gezegenine doğru yola çıkarlar. Gemideyken, biyoloji uzmanı Meredith Vickers (Charlize Theron) ve kaptanı Janek (Idris Elba) da dahil olmak üzere bir grup bilim insanı yer almaktadır. Prometheus gezegene vardığında, bilim insanları terk edilmiş bir uzaylı tesisini keşfederler. Burada, “Siyah Sıvı” olarak bilinen ve canlı organizmaları hızla mutasyona uğratabilen tehlikeli bir maddeyi bulurlar.